Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PHACTR1Q9C0D0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PHACTR1Q9C0D0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms