Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNTNAP4Q9C0A0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms