Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BCO2Q9BYV7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BCO2Q9BYV7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms