Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM55Q9BYV6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRIM55Q9BYV6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms