Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CARD11Q9BXL7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CARD11Q9BXL7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms