Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms