Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVT8

TMUB1, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1Q9BVT8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMUB1Q9BVT8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMUB1Q9BVT8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms