Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTA3Q9BTC8 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms