Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSEN34Q9BSV6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSEN34Q9BSV6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms