Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RTKNQ9BST9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTKNQ9BST9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms