Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDF4Q9BRK5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDF4Q9BRK5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms