Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CPPED1Q9BRF8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CPPED1Q9BRF8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms