Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF559Q9BR84 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms