Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TM9SF2Q99805 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM9SF2Q99805 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms