Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
RBBP8Q99708 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RBBP8Q99708 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms