Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EYA3Q99504 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EYA3Q99504 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms