Protein–RNA interactions for Protein: Q99502

EYA1, Eyes absent homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA1Q99502 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EYA1Q99502 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EYA1Q99502 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms