Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CTAGE1Q96RT6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTAGE1Q96RT6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms