Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A9Q96Q91 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A9Q96Q91 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms