Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF396Q96N95 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF396Q96N95 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms