Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM47Q96LD4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM47Q96LD4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms