Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPNS2Q96L46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPNS2Q96L46 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms