Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLPTM1LQ96KA5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLPTM1LQ96KA5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms