Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHAMP1Q96JM3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms