Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MS4A3Q96HJ5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SEPHS1P7-201ENST00000452995 1177 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MS4A3Q96HJ5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms