Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPNQ96H22 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms