Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX9

APIP, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIPQ96GX9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APIPQ96GX9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms