Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4CQ96DT6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4CQ96DT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms