Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RUNDC1Q96C34 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RUNDC1Q96C34 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms