Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RFT1Q96AA3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms