Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC4DQ8WXI8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLEC4DQ8WXI8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms