Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

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Length 791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATRIPQ8WXE1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATRIPQ8WXE1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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