Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOBEC4Q8WW27 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms