Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNX29Q8TEQ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX29Q8TEQ0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms