Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHDC4Q8TBB5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms