Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NEDD1Q8NHV4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms