Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NGDNQ8NEJ9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NGDNQ8NEJ9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms