Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SETD9Q8NE22 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms