Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BHLHE23Q8NDY6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BHLHE23Q8NDY6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms