Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4U5

TCP11L2, T-complex protein 11-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L2Q8N4U5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TCP11L2Q8N4U5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCP11L2Q8N4U5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms