Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYCP3Q8IZU3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYCP3Q8IZU3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms