Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPUSD2Q8IZ73 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPUSD2Q8IZ73 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms