Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP2Q8IXW5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP2Q8IXW5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms