Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPBP1Q86WP2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms