Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NLRP13Q86W25 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NLRP13Q86W25 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms