Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE3BQ7Z3V4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBE3BQ7Z3V4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms