Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RUFY3Q7L099 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RUFY3Q7L099 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms