Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYDE1Q6ZW31 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYDE1Q6ZW31 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms