Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CASC2Q6XLA1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CASC2Q6XLA1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms