Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SHISA2Q6UWI4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SHISA2Q6UWI4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms